污染原因芝棒污染的根本原因是競爭性雜菌入侵感染，芝棒大范圍污染事件多發(fā)生在靈芝栽培老產(chǎn)區(qū)，其污染原因歸納起來主要有以下幾個方面：栽培品種抗逆性減弱抗逆性減弱是品種種性退化的一個表現(xiàn)，這是芝棒污染的內(nèi)因。菌種不合格主要表現(xiàn)為栽培種帶有雜菌；菌齡過長，菌種老化，萌發(fā)力差，吃料慢，菌絲弱，接種后封面時間長；高溫、變溫培養(yǎng)的菌種，菌絲纖細無力，擴展緩慢。栽培季節(jié)安排不當(dāng)一是芝棒制作及接種期安排過晚（如2月以后），如春季突遇高溫天氣，發(fā)菌棚內(nèi)溫度達到40弋以上,極易“燒菌”，菌絲生理活動受到限制并逐漸死亡，各種雜菌趁機感染。二是芝棒制作及接種期安排過早（如11月以前），接種期間氣溫高，雜菌活躍，菌棒易感染。芝場環(huán)境污染主要是上年度染雜菌袋和出過芝的老袋以及當(dāng)年污染的菌袋在房前、屋后、馬路邊、芝場旁邊晾曬，沒有及時清理銷毀，致使大量霉菌孢子在空氣中飛揚，造成環(huán)境污染。

氣流粉碎法使壓縮空氣通過特定角度的研磨嘴進入研磨腔，產(chǎn)生高速的螺旋狀氣流，物料在螺旋氣流的帶動下在研磨腔內(nèi)高速旋轉(zhuǎn)，顆粒間由于不同速度而產(chǎn)生碰撞，從而達到粉碎的效果．例如，肖鑫等利用高壓氣流粉碎法處理靈芝抱子，破壁率達99%以上． 高壓均質(zhì)法．高壓均質(zhì)法利用高壓均質(zhì)機的撞擊、剪切、空化、湍流等作用，將物料“研磨”成小的顆粒，達到均質(zhì)化的效果．使用高壓均質(zhì)技術(shù)破除靈芝抱子細胞壁，破壁率平均值為94.35%．綜合法綜合法，即聯(lián)合運用以上4種方法中的2種及以上對靈芝抱子進行破壁．目前，國內(nèi)外的靈芝抱子破壁技術(shù)和方法，很少單獨使用，絕大多數(shù)是同時或先后使用上述幾種方法，以增加靈芝抱子的破壁率．其原因主要是:靈芝抱子十分小，且細胞壁十分堅韌，單獨的一種作用難以快速、徹底的破壞靈芝抱子壁，因此，綜合法的運用成為可能．就先后使用酶解法、低溫真空干燥法、低溫冷凍法、機械法等方法來處理靈芝抱子，以提高其破壁率．藥理作用靈芝抱子具有靈芝完全的遺傳物質(zhì)，因此兩者的藥理作用基本完全相似．隨著靈芝抱子研究的深入，其藥理作用越來越受到人們的關(guān)注．目前，國內(nèi)外對靈芝抱子藥理作用的研究主要集中于、免疫調(diào)節(jié)、抗氧化、神經(jīng)保護、保肝、抗等方面．作用

段木基質(zhì)變質(zhì)主要是裝袋時氣溫較高，裝袋后放置時間過長，沒有及時滅菌；料袋滅菌時升溫時間過長；段木基質(zhì)水份含量過大，均可造成段木基質(zhì)變性發(fā)酸等。塑料袋質(zhì)量差塑料袋太薄（0.035mm以下），質(zhì)量差,段木塊毛刺多，裝袋、接種及運輸過程中未輕拿輕放或機械破損，致使菌袋出現(xiàn)孔，造成污染。 罩膜初鼓起時，未放冷氣；袋破或底層袋泡水或扎口太松造成水袋；常壓滅菌保持時間不夠、溫度不夠或中間加水降至100弋以下時間太長；罩膜漏氣，溫度達不到要求值。接種時料溫太高接種時料袋溫度太高，超過菌種所能承受的溫度范圍，造成菌種被燙傷或燙死后不萌發(fā)并感染雜菌。培菌環(huán)境不良主要是培養(yǎng)室內(nèi)濕度過大，通風(fēng)不良，環(huán)境不潔，甚至有鼠害。個別芝農(nóng)在培養(yǎng)室內(nèi)灑水并使地面上存有積水，空氣相對濕度超過70％，利于雜菌滋生。