段木基質(zhì)變質(zhì)主要是裝袋時氣溫較高，裝袋后放置時間過長，沒有及時滅菌；料袋滅菌時升溫時間過長；段木基質(zhì)水份含量過大，均可造成段木基質(zhì)變性發(fā)酸等。塑料袋質(zhì)量差塑料袋太薄（0.035mm以下），質(zhì)量差,段木塊毛刺多，裝袋、接種及運輸過程中未輕拿輕放或機械破損，致使菌袋出現(xiàn)孔，造成污染。 罩膜初鼓起時，未放冷氣；袋破或底層袋泡水或扎口太松造成水袋；常壓滅菌保持時間不夠、溫度不夠或中間加水降至100弋以下時間太長；罩膜漏氣，溫度達不到要求值。接種時料溫太高接種時料袋溫度太高，超過菌種所能承受的溫度范圍，造成菌種被燙傷或燙死后不萌發(fā)并感染雜菌。培菌環(huán)境不良主要是培養(yǎng)室內(nèi)濕度過大，通風不良，環(huán)境不潔，甚至有鼠害。個別芝農(nóng)在培養(yǎng)室內(nèi)灑水并使地面上存有積水，空氣相對濕度超過70％，利于雜菌滋生。

加葡萄糖（處理③）。在基礎(chǔ)配方中添加牛肉膏和蛋白胨后，蟲草生長與只添加無機鹽相比沒有明顯差別，推測牛肉膏和蛋白胨提供的主要營養(yǎng)物質(zhì)———磷酸鹽、碳源、氮源和維生素在磷酸二氫鉀和硫酸鎂存在的情況下已并非限制性因子，即達到了營養(yǎng)飽和。因此再添加并不能有促進生長作用，反而由于添加物質(zhì)過多導(dǎo)致培養(yǎng)基縫隙過密，不利于出草。處理⑤和處理⑥的無機鹽和葡萄糖添加量相等，但分別添加了牛肉膏和蛋白胨，蟲草生長出現(xiàn)統(tǒng)計學差異，這可能是由于牛肉膏和蛋白胨分別添加導(dǎo)致培養(yǎng)基中C：N比例改變，牛肉膏中提供大量碳源，而蛋白胨提供大量氮源，而只有在合適的C：N前提下，蟲草子實體才能正常生長[7]。在葡糖糖提供了足夠碳源的基礎(chǔ)上，培養(yǎng)基中添加蛋白胨更適合蟲草生長。在大米培養(yǎng)基中只添加有機質(zhì)（處理②），蟲草的生長和只添加無機鹽相當，因此，在實際生產(chǎn)中，性質(zhì)穩(wěn)定而價格較低的無機鹽更為實用。段木熟料栽培靈芝生產(chǎn)工序多，菌棒污染原因多，每一個生產(chǎn)環(huán)節(jié)不注意都有可能造成芝棒污染。堅決杜絕不嚴格執(zhí)行操作規(guī)程，完全憑經(jīng)驗、想當然地進行段木靈芝生產(chǎn)的做法。一般而言，在品種優(yōu)良，菌種生長良好，段木基質(zhì)適宜，滅菌徹底，接種操作規(guī)范，培養(yǎng)條件適合，菌木達到生理成熟，芝棒下地及田間管理到位的條件下，就能夠生產(chǎn)出優(yōu)質(zhì)的靈芝產(chǎn)品。