后期管理控制溫度在22—28 空氣相對(duì)濕度在90%—95%，每天澆水一次，做到濕而不見水，忌長(zhǎng)時(shí)期積水，同時(shí)做好通風(fēng)管理，靈芝原基生長(zhǎng)迅速，日生長(zhǎng)速度可達(dá)0.5-1cm，邊緣向外擴(kuò)展，形成菌蓋，菌蓋邊緣乳白色，菌蓋一圈圈向外擴(kuò)散生長(zhǎng)。采收經(jīng)過(guò)20d左右，靈芝菌蓋邊緣乳白色-乳黃色圈消失，菌蓋開始革質(zhì)化，呈棕色，表明菌蓋已停止生長(zhǎng)，但還可進(jìn)行加厚生長(zhǎng)。菌蓋下面子實(shí)層內(nèi)彈射出棕紅色擔(dān)孢子時(shí)，表明子實(shí)體已成熟，即可采收。采收時(shí)用鋒利的小刀或果技剪在菌柄0.5-1cm處割取。采收后的子實(shí)體應(yīng)及時(shí)曬干或烘干，然后裝袋入庫(kù)儲(chǔ)藏。

前期管理（埋棒后20天）菌袋埋土后，主要為水分、通氣、溫度光照三要素的調(diào)節(jié)，要保持適宜的溫度、濕度、光照和控制通風(fēng)量，溫度要保持在22—26T，空氣相對(duì)濕度要保持在85%—90%，初期以保溫為主，白天拉開一層遮陽(yáng)網(wǎng)，接受光照，避免日光直射，增加土壤溫度，中午氣溫過(guò)高時(shí)，應(yīng)開窗通風(fēng)，噴水降溫。在漢中約15d原基便可零星露出土表。中期管理（埋棒后20—40d）氣溫上升，溫差較大，白天注意降溫，控制溫度在22—28空氣相對(duì)濕度要保持在90%—95%;晚間應(yīng)放下薄膜減少溫差。光照采用雙層遮陽(yáng)網(wǎng)控制，制造出閃爍型林下散射光。此階段，菌原基生長(zhǎng)較快，每2—3d要進(jìn)行通風(fēng)換氣，靈芝對(duì)二氧化碳非常敏感，否則，會(huì)造成靈芝菌柄長(zhǎng)、不開傘或畸形。在此期間要定苗修頭，原基生長(zhǎng)20d后海袋選留1株強(qiáng)勢(shì)菌株，并對(duì)其上生長(zhǎng)點(diǎn)進(jìn)行修頭，即修成馬蹄形，利于商品外形一致，提高靈芝菌蓋的商品率，一般次修完后10d，應(yīng)再進(jìn)行一次留株修頭。