碳源是微生物生長繁殖所必需的營養(yǎng)物質(zhì)。微生物如同生物處理系統(tǒng)中的“工作者”，而碳源就像是它們的“食物”。在生物處理反應(yīng)器中，微生物需要利用碳源來維持自身的生命活動，進(jìn)行自我增殖。例如，在傳統(tǒng)的污水處理工藝中，微生物通過攝取碳源中的碳元素構(gòu)建細(xì)胞物質(zhì)，進(jìn)而繁殖出更多的微生物個體，形成活性污泥的一部分，幫助降解污水中的有害物質(zhì)，提高系統(tǒng)處理污水的能力。穩(wěn)定的碳源供應(yīng)有助于維持微生物群落結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定和多樣性。就像一個生態(tài)系統(tǒng)中生物多樣性的保持，在污水處理的微生物體系里，如果碳源不足或者供應(yīng)不穩(wěn)定，優(yōu)勢微生物種群可能會過度生長，而其他微生物種群受到抑制，從而破壞整個微生物群落的平衡，降低系統(tǒng)對污水中各種污染物的處理能力。

在水產(chǎn)養(yǎng)殖環(huán)境中的作用穩(wěn)固水體菌藻相平衡：碳是藻類十分重要的營養(yǎng)元素，相當(dāng)于是藻類的骨架。向水體中補充含碳源的物質(zhì)能夠補充有機碳，穩(wěn)固水體菌藻相平衡，進(jìn)而穩(wěn)定水體的pH。例如很多水產(chǎn)養(yǎng)殖池塘中如果水中缺碳，藻類生長緩慢或者不穩(wěn)定，補充像乙酸鈉這樣的碳源，可以為藻類的生長提供必要的碳元素，促進(jìn)藻類的光合作用，增加水中的溶氧量；同時維持有益微生物在水體中的比例和活性，防止因天氣突變等原因引起水質(zhì)的劇烈變化，起到穩(wěn)定養(yǎng)殖水體生態(tài)環(huán)境的作用。促進(jìn)有益微生物和藻類繁殖：水體中的碳源富含發(fā)酵蛋白、河南南陽同城氨基酸和還原糖時，能有助于促進(jìn)有益藻類和微生物的繁殖生長，穩(wěn)定水色。水產(chǎn)養(yǎng)殖中的藻類可以為養(yǎng)殖生物提供氧氣、河南南陽本地作為食物來源等重要作用，有益微生物則有助于分解水體中的有害物質(zhì)、河南南陽本地調(diào)節(jié)水體生態(tài)環(huán)境等，所以碳源通過促進(jìn)它們的生長對整個養(yǎng)殖環(huán)境產(chǎn)生積極影響，如新生成的有益微生物能夠分解殘餌、河南南陽糞便等，防止水中有機物的過度積累。