前期管理（埋棒后20天）菌袋埋土后，主要為水分、通氣、溫度光照三要素的調(diào)節(jié)，要保持適宜的溫度、濕度、光照和控制通風(fēng)量，溫度要保持在22—26T，空氣相對濕度要保持在85%—90%，初期以保溫為主，白天拉開一層遮陽網(wǎng)，接受光照，避免日光直射，增加土壤溫度，中午氣溫過高時，應(yīng)開窗通風(fēng)，噴水降溫。在漢中約15d原基便可零星露出土表。中期管理（埋棒后20—40d）氣溫上升，溫差較大，白天注意降溫，控制溫度在22—28空氣相對濕度要保持在90%—95%;晚間應(yīng)放下薄膜減少溫差。光照采用雙層遮陽網(wǎng)控制，制造出閃爍型林下散射光。此階段，菌原基生長較快，每2—3d要進行通風(fēng)換氣，靈芝對二氧化碳非常敏感，否則，會造成靈芝菌柄長、不開傘或畸形。在此期間要定苗修頭，原基生長20d后海袋選留1株強勢菌株，并對其上生長點進行修頭，即修成馬蹄形，利于商品外形一致，提高靈芝菌蓋的商品率，一般次修完后10d，應(yīng)再進行一次留株修頭。

采用高壓滅菌的，升火前應(yīng)打開放氣閥門，當(dāng)水蒸氣大量噴發(fā)時，關(guān)閉放氣閥，加大火力，當(dāng)壓力表盤為0.15帕次放氣時開始計時，在此氣壓下持續(xù)4個小時即可停火。當(dāng)壓力表降至0帕?xí)r，打開放氣閥排氣，把壓力鍋門打開自然降溫。采用常用滅菌的，在蒸籠底部一角放一支溫度計，升火后溫度至100°C時開始計時，維持12個小時后停火，悶上一夜，然后打開蒸。當(dāng)料溫降至40°C時，移入接種袋或接種箱中，然后放入酒精、棉塞、包扎帶、氣霧消毒盒、火機、接種鉤、菌種，菌種用百菌清或5%水浸洗，同時有紅、綠、黃等色雜菌的菌種，每四筒料放一包菌種。一切就緒后封閉接種箱，點燃消毒盒20分鐘后可實現(xiàn)接種，接種時操作人員預(yù)先用75%酒精消毒雙手，然后小心伸入接種箱中，從尾部撕開種袋接種，種頭接近棉塞處的表皮種 棄之不用。地養(yǎng)室培養(yǎng)，此時培養(yǎng)室溫度保持24~30°C,12小時后種子開始萌發(fā)吃料，20天后當(dāng)菌絲長至筒料一半時，把接種端袋口稍稍打開通氣培養(yǎng)，菌絲長滿后，零星出現(xiàn)原基時，進入菌棚排場管理。