后期管理控制溫度在22—28 空氣相對濕度在90%—95%，每天澆水一次，做到濕而不見水，忌長時期積水，同時做好通風管理，靈芝原基生長迅速，日生長速度可達0.5-1cm，邊緣向外擴展，形成菌蓋，菌蓋邊緣乳白色，菌蓋一圈圈向外擴散生長。采收經(jīng)過20d左右，靈芝菌蓋邊緣乳白色-乳黃色圈消失，菌蓋開始革質(zhì)化，呈棕色，表明菌蓋已停止生長，但還可進行加厚生長。菌蓋下面子實層內(nèi)彈射出棕紅色擔孢子時，表明子實體已成熟，即可采收。采收時用鋒利的小刀或果技剪在菌柄0.5-1cm處割取。采收后的子實體應及時曬干或烘干，然后裝袋入庫儲藏。

發(fā)菌以“井”字形堆疊，高約1m，底部用石塊或廢木墊空，要求堆內(nèi)溫度控制在20兀以上、28兀以下，晴天中午氣溫高時應撐膜通風降溫。每周將段木上下、內(nèi)外翻動1次，促進發(fā)菌均勻。約經(jīng)30d，接種穴和樹皮下長滿菌絲，發(fā)菌結(jié)束。埋土養(yǎng)菌及子實體發(fā)生選排水良好、有水源或樹蔭下作菌床，畦床寬1.2m，深20cm。將段木橫向排放在菌床內(nèi)，段木間距5cm，以無雜質(zhì)的細壤土填沒段木間隙，而后上面覆2cm的土層。搭蔭棚離菌床高60cm，棚上蓋稀草簾，外覆薄膜，防止直射光和大雨沖刷。這段時間，減少水分供給，養(yǎng)菌約30d。當段木兩端斷面上具有黃白色菌絲即進入子實體發(fā)生階段，增加空間的濕度，晴天噴水1~2次，保持土壤濕潤。7月初子實體陸續(xù)發(fā)生。第2年5~7月盛產(chǎn)，第3年仍有子實體產(chǎn)生。