后期管理控制溫度在22—28 空氣相對濕度在90%—95%，每天澆水一次，做到濕而不見水，忌長時期積水，同時做好通風管理，靈芝原基生長迅速，日生長速度可達0.5-1cm，邊緣向外擴展，形成菌蓋，菌蓋邊緣乳白色，菌蓋一圈圈向外擴散生長。采收經(jīng)過20d左右，靈芝菌蓋邊緣乳白色-乳黃色圈消失，菌蓋開始革質(zhì)化，呈棕色，表明菌蓋已停止生長，但還可進行加厚生長。菌蓋下面子實層內(nèi)彈射出棕紅色擔孢子時，表明子實體已成熟，即可采收。采收時用鋒利的小刀或果技剪在菌柄0.5-1cm處割取。采收后的子實體應及時曬干或烘干，然后裝袋入庫儲藏。

入土排場管理場地選擇背風、水源好、日照短的場所，搭好遮陰棚，高度要求2米以上，陰度要求五分陰五分陽，四周開排水溝，中間開廂，廂寬2.5米，長不限，廂與廂之間留30厘米人行道，把移到芝場已長好的筒料外袋撕掉，并排緊靠人行道兩旁，然后用地膜覆蓋防雨，在地膜上撒上細土，以不見地膜為宜，4~5天后扒開細土，撕開地膜，觀察菌絲已恢復，并且相互連接時，即可把地膜全部取走，蓋上細土，土高出筒料2厘米，上面撒上樹枝、樹葉等，此后經(jīng)常噴水保濕，當氣溫升至18~24°C時會大量現(xiàn)蕾，此時可根據(jù)需要，摘除太密的菌蕾，以防靈芝開傘時形成連體芝。如需要制作特大靈芝，可加厚覆土，在需要長芝的地方讓菌筒小面積裸露，用草木灰水噴灑這個部位，進行定點刺激、定點出菇，如在這個部分出現(xiàn)多個芝柄，即可以除小留大，選無蟲害的一個芝柄。制作一個特大靈芝需要做好預算：“長腳紫芝07-6”每百公斤柴種一年可產(chǎn)五年，年可產(chǎn)1公斤干品，第二年可產(chǎn)2公斤干品，第三年可產(chǎn)1.5公斤干品，第四年可產(chǎn)1公斤干品，第五年可產(chǎn)0.5公斤干品。如果想入土當年制作一個5公斤重的靈芝，則一定要放足500公斤菌材。如果想制作更大的靈芝，那么就要考慮配方上的生物素的加足量。靈芝是，所以整個制作過程中不能用多菌靈、敵敵畏等含硫物質(zhì)。如果靈芝出現(xiàn)害蟲，可用紫外線燈于夜間滅殺，每晚滅殺4個小時即可，每50平方米放上一支紫外線燈。如菌體上已經(jīng)出現(xiàn)害蟲，那就只能用手工捉殺，或摘除出售。