袋栽與瓶栽過程相似，只是采用聚乙烯或聚氯乙烯塑料袋，裝至離袋口約10cm處，收攏袋口，套塑料套環(huán)，加棉塞。滅菌，在無菌條件下接種培養(yǎng)。當(dāng)菌絲長到袋的1/2左右時拔去棉塞和套環(huán)，露出料面，讓其出芝。注意不要過早打開袋口，以免菌絲干涸而影響子實(shí)體發(fā)生。段木栽培選擇櫟樹、榆樹、樺木等闊葉樹種，樹齡7~10年，樹徑6~15cm。砍伐截段伐樹在落葉后至翌年萌芽前進(jìn)行，砍伐時不要損傷樹皮。接種前鋸成段，浸水12?15h，增加含水量，以利發(fā)菌。打孔接種用皮帶沖安裝在接種錘上打孔，直徑約9.6?10mm，隨即用接種槍接入菌種，然后用樹皮蓋封穴，接種選晴天進(jìn)行，做到邊打孔，邊接種，邊封穴。

段木基質(zhì)變質(zhì)主要是裝袋時氣溫較高，裝袋后放置時間過長，沒有及時滅菌；料袋滅菌時升溫時間過長；段木基質(zhì)水份含量過大，均可造成段木基質(zhì)變性發(fā)酸等。塑料袋質(zhì)量差塑料袋太薄（0.035mm以下），質(zhì)量差,段木塊毛刺多，裝袋、接種及運(yùn)輸過程中未輕拿輕放或機(jī)械破損，致使菌袋出現(xiàn)孔，造成污染。 罩膜初鼓起時，未放冷氣；袋破或底層袋泡水或扎口太松造成水袋；常壓滅菌保持時間不夠、溫度不夠或中間加水降至100弋以下時間太長；罩膜漏氣，溫度達(dá)不到要求值。接種時料溫太高接種時料袋溫度太高，超過菌種所能承受的溫度范圍，造成菌種被燙傷或燙死后不萌發(fā)并感染雜菌。培菌環(huán)境不良主要是培養(yǎng)室內(nèi)濕度過大，通風(fēng)不良，環(huán)境不潔，甚至有鼠害。個別芝農(nóng)在培養(yǎng)室內(nèi)灑水并使地面上存有積水，空氣相對濕度超過70％，利于雜菌滋生。