前期管理（埋棒后20天）菌袋埋土后，主要為水分、通氣、溫度光照三要素的調(diào)節(jié)，要保持適宜的溫度、濕度、光照和控制通風(fēng)量，溫度要保持在22—26T，空氣相對(duì)濕度要保持在85%—90%，初期以保溫為主，白天拉開(kāi)一層遮陽(yáng)網(wǎng)，接受光照，避免日光直射，增加土壤溫度，中午氣溫過(guò)高時(shí)，應(yīng)開(kāi)窗通風(fēng)，噴水降溫。在漢中約15d原基便可零星露出土表。中期管理（埋棒后20—40d）氣溫上升，溫差較大，白天注意降溫，控制溫度在22—28空氣相對(duì)濕度要保持在90%—95%;晚間應(yīng)放下薄膜減少溫差。光照采用雙層遮陽(yáng)網(wǎng)控制，制造出閃爍型林下散射光。此階段，菌原基生長(zhǎng)較快，每2—3d要進(jìn)行通風(fēng)換氣，靈芝對(duì)二氧化碳非常敏感，否則，會(huì)造成靈芝菌柄長(zhǎng)、不開(kāi)傘或畸形。在此期間要定苗修頭，原基生長(zhǎng)20d后海袋選留1株強(qiáng)勢(shì)菌株，并對(duì)其上生長(zhǎng)點(diǎn)進(jìn)行修頭，即修成馬蹄形，利于商品外形一致，提高靈芝菌蓋的商品率，一般次修完后10d，應(yīng)再進(jìn)行一次留株修頭。

選用優(yōu)良品種，對(duì)退化品種進(jìn)行提純復(fù)壯選用抗病性強(qiáng)、生活力強(qiáng)、高純度的菌種進(jìn)行接種。經(jīng)多年試驗(yàn)示范，以采收子實(shí)體為主的菌株“日本赤靈芝”，采芝、收粉兼用型菌株“黃山8號(hào)”兩個(gè)優(yōu)良菌株較適宜我省氣候特點(diǎn)及段木熟料靈芝栽培模式，由于栽培多年，該兩個(gè)品種有退化趨勢(shì)，需進(jìn)行提純復(fù)壯。科學(xué)安排栽培季節(jié)根據(jù)中原地區(qū)氣候特點(diǎn)，短段木靈芝菌棒制作期選在11月上旬至翌年2月上旬為宜，在此時(shí)段內(nèi)，為讓菌絲有足夠的發(fā)菌時(shí)間，宜利用當(dāng)?shù)貧夂蛸Y源，提早制作菌棒。選擇環(huán)境良好的芝地選擇芝場(chǎng)時(shí)，要求前茬沒(méi)栽培過(guò)食用菌，同一塊芝地上下茬隔2年以上，不同年份的2塊芝地之間相距100m以上。環(huán)境質(zhì)量符合NY5010-2002標(biāo)準(zhǔn)。采取措施防止基質(zhì)變質(zhì)適宜菌絲生長(zhǎng)的段木塊含水量是33%~48%，若原木砍伐時(shí)間較長(zhǎng)，可于截段前或截段后浸水5~24h或加大填充用木屑的含水量。裝袋后要盡快碼袋滅菌，冬季裝袋后到滅菌開(kāi)始的時(shí)間間隔也不宜超過(guò)2d。注意一次性滅菌數(shù)量不宜太多（10000袋以內(nèi)為宜），以免造成滅菌不徹底、基質(zhì)變質(zhì)，延長(zhǎng)滅菌、接種時(shí)間，增加菌袋感染率。