段木基質(zhì)變質(zhì)主要是裝袋時(shí)氣溫較高，裝袋后放置時(shí)間過(guò)長(zhǎng)，沒(méi)有及時(shí)滅菌；料袋滅菌時(shí)升溫時(shí)間過(guò)長(zhǎng)；段木基質(zhì)水份含量過(guò)大，均可造成段木基質(zhì)變性發(fā)酸等。塑料袋質(zhì)量差塑料袋太薄（0.035mm以下），質(zhì)量差,段木塊毛刺多，裝袋、接種及運(yùn)輸過(guò)程中未輕拿輕放或機(jī)械破損，致使菌袋出現(xiàn)孔，造成污染。 罩膜初鼓起時(shí)，未放冷氣；袋破或底層袋泡水或扎口太松造成水袋；常壓滅菌保持時(shí)間不夠、溫度不夠或中間加水降至100弋以下時(shí)間太長(zhǎng)；罩膜漏氣，溫度達(dá)不到要求值。接種時(shí)料溫太高接種時(shí)料袋溫度太高，超過(guò)菌種所能承受的溫度范圍，造成菌種被燙傷或燙死后不萌發(fā)并感染雜菌。培菌環(huán)境不良主要是培養(yǎng)室內(nèi)濕度過(guò)大，通風(fēng)不良，環(huán)境不潔，甚至有鼠害。個(gè)別芝農(nóng)在培養(yǎng)室內(nèi)灑水并使地面上存有積水，空氣相對(duì)濕度超過(guò)70％，利于雜菌滋生。

第3個(gè)是六芝和靈芝之間的聯(lián)系，在中國(guó)古代“靈芝”一詞有很多含義，而《神農(nóng)本草經(jīng)》中的六芝只是根據(jù)藥性進(jìn)行系統(tǒng)的分類(lèi)。人們將靈芝當(dāng)作祥瑞，大概認(rèn)為它有“靈”，主要是由藥性和豐富的象征意象共同決定。一些專(zhuān)家學(xué)者將六芝與靈芝進(jìn)行對(duì)比分析得出結(jié)論：六芝從根本上說(shuō)，它的組成只是由赤芝和紫芝?！渡褶r(nóng)本草經(jīng)》中記載的黃芝、白芝、青芝、黑芝四芝，在其他古代藥物著作中，對(duì)它們的記載很少，對(duì)它們的記載，第1個(gè)是《本草綱目》，書(shū)中是這樣描述的：黑芝又非常撤且多黃白，稀有黑青者；第2個(gè)是《瑞應(yīng)圖》，書(shū)中是這樣描述的：芝草常以六月生，春青、夏紫、秋白、冬黑。根據(jù)現(xiàn)代的藥物研究者研究和查找相關(guān)藥物著作得出：赤芝在成長(zhǎng)階段，初的菌蓋是白色或者是黃白色，紫芝的菌蓋顏色比較深，接近于黑色。古代醫(yī)學(xué)著作中所記載的黃芝、白芝、青芝、黑芝四芝也可能指的就是赤芝及紫芝。一些藥物學(xué)家認(rèn)為，靈芝的主要特征是菌蓋的外形像人的腎臟，半圓形或者類(lèi)似于圓形，表面顏色呈褐黃色或紅梅色，有很好的光澤性，還具有菌柄。菌肉的上半部分的顏色較淺，下半部分較深，與許多醫(yī)學(xué)著作所記載赤芝很相似，因此赤芝這一類(lèi)靈芝可以作為靈芝的代表的說(shuō)法是很有權(quán)威性的，推測(cè)古代醫(yī)學(xué)著作中的靈芝就是赤芝。